В сельском хозяйстве в целях сохранения численности поголовья северных домашних оленей и традиционного уклада жизни были созданы два муниципальных унитарных предприятия – МУП «Оленекское» и МУП «Жилиндинское». На базе этих хозяйств сохранили 1500 голов оленей и в дальнейшем, в период 2008-2013 годов, благодаря поддержке администрации района, довели численность поголовья оленей до 5100 голов. Впоследствии, МУП «Оленекский» стал племенным репродуктором РФ по эвенкийской породе оленей. Необходимо отметить, что Прокопий Романович добился включения в бюджет района статей расхода поддержке оленеводства, обеспечения оленеводов спецодеждой и табельным снаряжением, продуктами питания. Было введено круглогодичное сезонное авиаобслуживание оленеводов. Результаты работы Николаева П.Р. по развитию традиционных отраслей Севера были высоко оценены республиканским Минсельхозом и Прокопий Романович в 2010 г. был признан лучшим главой муниципального района в сфере развития сельского хозяйства.
В 2013 г. Прокопий Романович по решению руководства республики был назначен генеральным директором ОАО «Якутская птицефабрика». В период его руководства птицефабрикой было произведено финансовое оздоровление предприятия, модернизировано и расширено производство, увеличен выпуск продукции. Одним из первых руководителей предприятий АПК республики, Николаев П.Р. реализовал проект собственной электрогенерации, запустив в декабре 2014 года микротурбинный энергоцентр общей мощностью 650 кВт.
В мае 2017 г. Прокопию Романовичу руководство республики предложило возглавить Государственный комитет Республики Саха (Якутия) по делам Арктики. В период работы на посту председателя Госкомитета Прокопию Романовичу удалось доказать необходимость и добиться включения в перечень Арктических районов Российской Федерации еще 8 улусов, увеличив таким образом количество Арктических районов до 13.
Госкомитет в годы работы Николаева П.Р. добился стабилизации численности поголовья северных домашних оленей. Началось укрепление материально-технической базы оленеводства и рыбохозяйственного комплекса республики. Так, все крупные рыболовецкие хозяйства до среднего течения основных рек Лена, Колыма, Яна и Индигирка были обеспечены современным оборудованием. Благодаря принятым мерам и решениям улучшилось качество поставляемой летней рыбы, ежегодный объем реализации увеличился до 5000 тонн рыбы. Соответственно выросли доходы рыбаков. В Чернышевском рыборазводном заводе впервые в условиях Якутии начали разводить сибирского осетра и выпускать мальков в реки Якутии.
В 2019 г. Прокопий Романович был назначен заместителем министра сельского хозяйства Республики Саха (Якутия) и стал курировать традиционные отрасли – северное домашнее оленеводство, звероводство, охотничий промысел и рыболовство. В министерстве он продолжил работу по модернизации производительных сил традиционных отраслей Севера.
Впервые в условиях Якутии был начат пилотный проект по изгородному содержанию оленей в условиях таежной зоны на базе КРО КМНС «Исток» Нерюнгринского района. Проект поддержали администрация Нерюнгринского района и ООО «Эльгауголь». Промышленная компания взяла на себя обязательство по финансированию строительства сети коралей, изгородей, маршрутных домиков и технического оснащения оленеводов. Также в оленеводстве успешно апробирован и реализуется социальный проект «Молодой Оленевод», оказывается поддержка оленеводам в виде единовременной выплаты в размере 2 млн. рублей на улучшение жилищных условий. Необходимо отметить, что в 2026 году Якутия заняла второе место после Ямало-Ненецкого округа по численности домашних оленей в Российской Федерации.
В отрасли звероводства была проведена успешная адаптация по разведению клеточных соболей в условиях Якутии на примере зверохозяйства Хангаласского района. В разведении серебристо-черных лисиц Якутии были введены новые подвиды лисиц скандинавского типа.
